Wspierany przez nas projekt World Community Grid staje się częścią Krembil Research Institute

We wrześniu 2021 roku ogłoszono zmiany w projekcie World Community Grid zarządzanym do tej pory przez IBM. Najważniejszą z nich jest przejęcie przedsięwzięcia przez Krembil Research Institute, instytucję naukowo-badawczą z siedzibą w Toronto. Firma IBM zapoczątkowując inicjatywę WCG w 2004 roku miała na celu stworzenie sieci pozwalającej na przeprowadzanie obliczeń rozproszonych na komputerach wolontariuszy.

Zmiana opiekuna platformy nie wpłynie na dalsze działanie projektu, a aktualnie prowadzone badania będą kontynuowane. Wolontariusze nadal będą mogli udostępniać moc obliczeniową swoich maszyn, aby wesprzeć naukowców w poszukiwaniu skuteczniejszych metod leczenia COVID-19, nowotworów, AIDS czy chorób tropikalnych.

Z powodu migracji rozwiązania pomiędzy dwoma organizacjami, od 14 lutego nie będzie można wykonywać obliczeń, aż do bezpiecznego zakończenia całego procesu, który nastąpi z końcem marca lub kwietnia. Dokładna data przywrócenia projektu nie jest znana. Z tej okazji postanowiłem podsumować dotychczasową działalność Apollogic w ramach inicjatywy WCG.

 

Wyświetl ten post na Instagramie

 

Post udostępniony przez Apollogic (@apollogicteam)

Co udało nam się zdziałać?

Infrastrukturę składającą się z dziesięciu nieużywanych laptopów uruchamialiśmy stopniowo, począwszy od kwietnia 2021. Część komputerów działa na Windowsie, część na Linuxie. Znaleźliśmy w Apollogic pokój, w którym komputery zostały umieszczone, podłączone do prądu i – ze względów bezpieczeństwa – do oddzielnej sieci. Wchodząc do tego pokoju można poczuć przyjemny powiew ciepłego powietrza. Warto podkreślić, że urządzenia, o których mowa, przez cały czas wykorzystują 100% możliwości procesora.

Jakie są wyniki naszych działań?

Uprzedzam, że liczba, którą zaraz podam, może się wydać kosmiczna. Spieszę więc z wyjaśnieniami. W ramach naszej infrastruktury, złożonej z dziesięciu laptopów, wygenerowaliśmy około dwadzieścia pięć lat czasu obliczeniowego, odsyłając do WCG ponad 45000 przeliczonych próbek. Większość mocy poświęciliśmy projektowi Mapping Cancer Markers, którego celem jest lepsze zrozumienie biologii nowotworów, identyfikacja markerów związanych z różnymi typami raka i poszukiwanie efektywnych sposobów walki z tą chorobą.

Skąd wzięło się dwadzieścia pięć lat pracy, skoro dziesięć komputerów oddaje swoją moc obliczeniową przez niecały rok? Każdy z procesorów w naszych komputerach jest wielordzeniowy i wielowątkowy, co oznacza, że jeden komputer może w tym samym czasie przeliczać kilka próbek. Stąd jeden komputer z czterema wątkami potrafi w ciągu doby wygenerować dziewięćdziesiąt sześć godzin czasu obliczeniowego.

Czy infrastruktura wymaga dużo uwagi?

Po uruchomieniu komputery pracujące na rzecz projektu WCG nie wymagają wiele naszej uwagi. Urządzenia od czasu do czasu się restartują, chociażby z powodu aktualizacji, lub wyłączają wskutek chwilowej przerwy w dostawie prądu, co dzieje się w przypadku komputerów z niedziałającą baterią. Wówczas wystarczy ponownie uruchomić urządzenie, aby automatycznie przywrócić dotychczasowe czynności. Wykrycie komputerów wymagających włączenia jest proste, ponieważ panel administracyjny na stronie WCG pozwala monitorować urządzenia, które mamy podłączone do sieci i sprawdzić, kiedy po raz ostatni komunikowały się z serwerem WCG.

Czy wszystkie komputery przetrwały?

Jak na razie tylko jeden z naszych komputerów zaczął odmawiać posłuszeństwa i został wycofany z projektu. Rzeczone urządzenie wykazywało już problemy z matrycą, ale sprawny procesor umożliwił oddanie mocy obliczeniowej w szczytnym celu. Niestety, po ponad roku nieustannej pracy układ chłodzenia zaczął szwankować, przez co komputer nie nadaje się już do dalszych obliczeń. Muszę przyznać, że jestem pod wielkim wrażeniem, jak dzisiejsze laptopy działające na pełnych obrotach przez całą dobę, radzą sobie z pracą w takich warunkach. Wcześniej zakładałem, że laptopy biurowe nie są przystosowane do wykonywania tak obciążanych czynności, jednak pozytywne się zaskoczyłem.

Co stanie się z naszymi komputerami podczas przerwy?

Dwumiesięczna przerwa w działaniu przedsięwzięcia World Community Grid nie studzi naszego zapału i chęci wparcia badań naukowych z pomocą dostępnych zasobów sprzętowych. Planujemy testować nasze komputery pod kątem udziału w projekcie Rosetta@Home, którego celem jest projektowanie struktur i kompleksów białkowych, co pomoże w walce z wieloma współczesnymi chorobami. Badania prowadzone są przez naukowców z Uniwersytetu w Waszyngtonie. Jeżeli nasze komputery okażą się wystarczająco mocne, użyjemy ich do wsparcia tego projektu.

Oddolna inicjatywa, która początkowo miała być tylko eksperymentem, przerodziła się w stały element funkcjonowania naszej firmy. Cieszymy się, że możemy wspierać przełomowe badania i mamy nadzieję, że naukowcom uda się przyczynić do rozwiązania największych problemów związanych z opieką zdrowotną.